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由于果壳活性炭对水的预处理要求高，而且果壳活性炭的价格相对不低，因此在废水处理中，果壳活性炭主要用来去除废水中的微量污染物，以达到深度净化的目的。
1.果壳活性炭处理含铬废水
铬是电镀中用量较大的一种金属原料，在废水中六价铬随pH值的不同分别以不同的形式存在。
果壳活性炭有非常发达的微孔结构和较高的比表面积，具有极强的物理吸附能力，能有效地吸附废水中的Cr（Ⅵ）.果壳活性炭的表面存在大量的含氧基团如羟基（-OH）、羧基（-COOH）等，它们都有静电吸附功能，对Cr（Ⅵ）产生化学吸附作用。完全可以用于处理电镀废水中的Cr（Ⅵ），吸附后的废水可达到国家排放标准。
试验表明：溶液中Cr（Ⅵ）质量浓度为50mg/L，pH=3，吸附时间1.5h时，果壳活性炭的吸附性能和Cr（Ⅵ）的去除率均达到良好效果。
因此，利用果壳活性炭处理含铬废水的过程是果壳活性炭对溶液中Cr（Ⅵ）的物理吸附、化学吸附、化学还原等综合作用的结果。果壳活性炭处理含铬废水，吸附性能稳定，处理*，操作费用低，有一定的社会效益和经济效益。
2.果壳活性炭处理含氰废水
在工业生产中，金银的湿法提取、化学纤维的生产、炼焦、合成氨、电镀、煤气生产等行业均使用氰化物或副产氰化物，因而在生产过程中必然要排放一定数量的含氰废水。
果壳活性炭用于净化废水已有相当长的历史，应用于处理含氰废水的文献报道也越来越多。但由于CN_、HCN在果壳活性炭上的吸附容量小，一般为3mgCN/gAC～8mgCN/gAC（因品种而异），在处理成本上不合算。
3.果壳活性炭处理含汞废水
果壳活性炭有吸附汞和含汞化合物的性能，但吸附能力有限，只适宜于处理含汞量低的废水。如果含汞的浓度较高，可以先用化学沉淀法处理，处理后含汞约1mg/L，高时可达2-3mg/L，然后再用果壳活性炭做进一步的处理。
4.果壳活性炭处理含酚废水
含酚废水广泛来源于石油化工厂、树脂厂、焦化厂和炼油化工厂。经实验证明：果壳活性炭对苯酚的吸附性能好，温度升高不利于吸附，使吸附容量减小；但升高温度达到吸附平衡的时间缩短。果壳活性炭的用量和吸附时间存在良好值，在酸性和中性条件下，去除率变化不大；强碱性条件下，苯酚去除率急剧下降，碱性越强，吸附效果越差。
5.果壳活性炭处理含甲醇废水
果壳活性炭可以吸附甲醇，但吸附能力不强，只适宜于处理含甲醇量低的废水。工程运行结果表明，可将混合液的COD从40mg/L降至12mg/L以下，对甲醇的去除率达到93.16%～100%，其出水水质可以满足回用到锅炉脱盐水系统进水的水质要求。
6.炼油厂的深度处理果壳活性炭
炼油厂含油废水，经隔油，气浮和生物处理后，在经砂滤和果壳活性炭过滤深度处理。废水的含酚量从0.1mg/L（经生物处理后）降至0.005mg/L，氰从0.19mg/L降至0.048mg/L，COD从85mg/L降至18mg/L.
