一、农村财务审计存在的问题1、机构不健全，审计力度小我县目前共有600个行政村，全县在农业部门设有专门农村财务审计服务站，现只有2名专职的审计人员，乡镇没有专门的农村财务审计机构，随着村级财务问题日益增多，村民要求对村集体财务进行审计的要求也特别强烈！按目前的人员配备，2个专职审计人员对财务问题特别混乱的村进行审计也力不从心，更谈不上对村干部的经济责任审计、离任审计等.省农业行政部门还提出三年一轮审任务，如果要严格按照审计程序进行，是不可能完成的任务，只能通过抽调各乡镇农村财务代理人员交叉检查来完成任务！
这样既能克服农村经济审计站审计独立性缺失对审计监督力度的影响，又能增强审计的权威性！2、规范农村财务管理制度要按章办事，完善制度，强化村级财务内部控制，没有规矩不成方圆，要规范农村财务，制度建设是保障，要正视村账镇（乡）管在操作、核算、监督、管理上出现的端，制定切实可行的财务管理操作规范，完善内部控制制度.如完善村财务公开和民主理财制度、民主决策制度、费用开支和资金收支审批制度、统一村干部补贴报酬管理制度及招待费用开支规定等，使村级财务管理逐步达到制度化、规范化、法制化的要求。
二、加强农村财务审计的思路与对策1、建立完善乡镇审计制度！目前乡镇审计没有具体的法规和规章，应当参照国家审计的有关规范原则，结合农村财务审计特点，由国家尽快制订有关乡镇审计的法律、法规及管理办法，实现乡镇审计法制化、制度化和规范化建设！同时应重视吸纳和培养高素质审计人才，建立起一支高素质的基层审计队伍，以适应农村新形势发展的需要!另外也可以探索建立新的、相对独立的农村审计新模式，例如建立统一的农村经济审计中心，承担乡镇各村的财务审计监督和配合经济责任的追究工作。
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2、财务不规范，审计时间长长久以来我县大部份村集体经济非常簿弱，基本上没有集体经营收入，就是因为村里没钱，大家对村级财务的管理也不重视。在实行村账代理制度以前，村里做账非常随意，有的就记录在纸片或香烟壳上，根本没有按财务制度和会计处理流程做账的概念。自从2003年实行村账委托代理以后，这些现象有所改善，但是村级财务管理还是非常混乱，大量存在自制的白条、收据和报销单，而且村级财务有问题的村可能一年或者几年都没有报账入账，审计人员不但要查账，有时还要替村里做账。
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另外由于历史原因，村里支出没有使用正规的票是普遍现象，如果严格按照财务制度来执行，全部给于否定，对于村干部也是非常不公平，恐怕也会引起社会不稳，因此审计时对于白条、普通收据、报销单等真实性的核实要花大量的时间.虽然有些村总的凭证量不多，但是村级财务审计，不仅是简单的账账、账票、账证上的核对，还要涉及真实性和合理性的调查！根据以往的经验，一般情况下要完成一个村的财务审计，从前期的审前调查到后得出审计结论至少要两个左右的时间，时间长。
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3、创造良好的农村审计环境尽快围绕国家和省、市制定出台相应的法律、法规或规范性文件，逐步理顺农村审计的管理体制，明确提高农村审计的法律地位，大限度地赋予农村合作经济组织审计部门必要的职权，要遵循依法独立审计的原则，审计人员依照法律法规行使职权时，要充分保障审计人员调取证过程中不受到任何单位、组织、个人以任何形式干预、阻挠！通过宣传、结果公告等措施，努力提高社会各界，特别是农民群众对农村财务审计工作的理解和支持，这是农村财务审计工作的群众基础。
3、职权不明确，取证难度大目前，我县农村财务审计的法律法规主要是根据农业部出台的《农村集体经济组织审计规定》和浙江省政府出台的《浙江省农村集体经济审计办法》，而且从审计机构的名称上看，县农业部门的审计机构还是一个服务性机构，虽然法律法规赋于审计人员有一定的职权，但是当职权行使不了的时候，也没有什么保障.例如，被审计人员或相关人员不配合时，也没有好的办法，或者和村里有资金来往的人员对于审计人员的到来也相当的警惕，向他取证时不愿意多讲，都以时间长了，不记得为由给于推脱，或者对村干部之间相互串供也没有强制措施！
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