学校奉行医教协同、校企合作、产教融合的办学理念！积极开拓校外实习基地并签订校企合作协议。学院拥有昆明市五华区人民医院（非直属附属医院）、云南博亚医院（附属医院）、昆明市第二人民医院、昆医附二院石林天奇医院和安宁鑫湖医院3家教学医院和昆明医科大学第一附属医院、医科大学第二附属医院、医科大学第三附属医院等45家实习医院.实习企业有云南白药集团、修正药业集团、鸿翔一心堂药业等32家，产教融合基地有昆明定美义齿制作有限公司等3家，就业基地有昭通市精神卫生中心、芒市护康医院等4家医院。
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学校师资力量雄厚，专业技术职称以上教师占专任教师的50％，专任教师中研究生以上学历占48％，双师型教师占专任教师的58％.学校积极引进各大高校、医院知名专家教授、主任医师、博士、到校开展教学科研工作！学校建有实验实训室71间，拥有专业的基础实验（训）中心、口腔医学实验（训）中心、护理实验（训）中心、药化实验（训）中心等多个实验（训）中心和临床微生物学检验实验室、临床分子生物学检验实验室、药物分析实验室等多个实验室.
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云南医药健康职业学院是在云南经济管理学院医学院基础上分立设置的一所经教育部批准具有独立颁发学历文凭资格的全日制医药类高等院校.集团为合理配置教学资源，发挥专业优势，由云南医药健康职业学院统筹管理云南经济管理学院医学院，共享教育资源、协同发展，搭建培养医学人才的摇篮。学校地理位置优越，现有昆明校区和安宁校区，交通便利，环境优美，建有现代化教学楼、图书馆、体育馆、标准田径运动场、设备先进的医学及医学技能实训中心、现代图文信息中心、生命馆和百草园及学生公寓、教工宿舍、食堂、超市等完备的教学生活设施，基础建设投资达57亿元，教学科研仪器价值4500余万元！
为学生实训、实习、就业提供了可靠保障，现已形成了“校院一体、医教融合”的办学特色，在同类院校中独树一帜！云南医药健康职业学院下设5个系部，目前学校设有口腔医学（临床医学类）、临床医学（临床医学类）、针灸推拿（临床医学类）、口腔医学技术、医学检验技术、医学影像技术、医学美容技术、护理、中药学和康复治疗技术等17个专科专业!云南经济管理学院医学院下设护理学、中药学、口腔医学技术、医学检验技术等8个本科专业和护理、药学等9个专科专业。
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