培养目标：培养掌握临床医学基本理论、基本知识和基本技能，适应我国医药卫生事业现代化发展，德、智、体、美、劳全面发展的高素质技能型人才。主干课程：诊断学、内科学、外科学、妇产科学、儿科学、基本公共卫生服务实务等。就业方向：能在各级各类医疗机构、卫生院、社区卫生服务中心（站）等医疗卫生机构从事临床医疗服务工作外语语种：英语、日语、韩语、泰语、越南语、缅语、老挝语、柬埔寨语（任选一种）基础医学系开设有临床医学（临床医学类）、健康管理两个专业，临床医学专业为国家控制高职专业！
正宗医药健康临床医学专业
康复治疗学专业培养适应我国医疗卫生事业发展需要，拥有良好道德品质、敬业奉献精神，系统掌握康复医学专业知识和技能，能在各级医疗、社区、疗养院或康复机构从事康复治疗、康复教育和康复工程研究等工作的高素质应用型人才【主干课程】康复功能评定学、运动疗法学、作业治疗学、言语治疗学、物理因子治疗学、中国传统康复治疗学、神经康复物理/作业治疗、骨骼肌肉系统疾病物理/作业治疗！基础医学系采用理实一体化教学、案例式教学、混合式教学、PBL等教学方法，激发学生的学习兴趣，寓教于乐；积极打造“金课”，全面推动课程建设，提升教学质量。
医药健康临床医学专业
着重培养学生的实践能力，举办“人体解剖学DIY模型制作大赛”、“人体解剖结构绘画大赛”等技能大赛活动。基础医学系拥有30余家校外实习实训基地，基本覆盖云南省，涵盖教育、卫生、医疗、社区、体检机构、保险机构、商业健康管理服务机构、健康管理咨询机构、健康体检中心、养生保健中心等单位，主干课程：诊断学、内科学、外科学、妇产科学、儿科学、基本公共卫生服务实务等.就业方向：能在各级各类医疗机构、卫生院、社区卫生服务中心（站）等医疗卫生机构从事临床医疗服务工作!
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现有实验室18间，涵盖人体解剖学、生理学、病理学、诊断学、外科学、内科学等方向.五华区人民医学院（非直属附属医院）、云南博亚医院（附属医院）、昆明市第二人民医院等。基础医学系教师积极参加校级、省级教学技能比赛并荣获各类荣誉奖项.教师荣获云南省民办教师荣誉称号、校级教师荣誉称号.基础医学系教师立项省厅级科研课题3项，申报产学研项目2项，校级课题及质量工程、精品课程12余项，公开发表普通期刊论文24余篇，获得专利授权2项，申报云教材2项，申报课程1项。
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